Подскажите названия средних кланов с боями в своей нише. Чтоб большее количество
боев было на равных с минимальным противостояние против топов. Есть ли сейчас
программное ограничение или сильные нападают на что захотят?

Нападают на что хотят

Вот вам рейтинг синдикатов, выбирайте сами.
http://www.gwars.io/srating.php