Есть достоверная информация: учитываются только слоты голова, тело и ноги, или маскировка и тепловизор тоже?

Где ты вообще видишь бонусную программу на модификаторы, поделись ссылкой.

Ну не так выразился.

специальный режим выпадения крайне редких модификаторов на оружие и броню на время новогодней программы

Модификатор оружия может выпасть только на слот правая рука (одноручное или двуручное оружие).
Модификатор брони может выпасть на слоты: голова, корпус, спина, ноги, очки.
[GanjaWiki : Модификатор]