После выполнения 40 + квестов сохраняются все полученные бонусы или как?

Накапливаются дальше.
И если пропустить теряешь -2

[GanjaWiki : Ежедневные_квесты]

Бонусы даются только за первые 40 дейликов. Дальше они продляются. Если перестать их выполнять - они будут пропадать по 2 за один пропуск.