Можно ли чтобы у одного синдиката было две базы? Чтобы одни воевали на Z, другие на G?

Если да то подскажите, как построить вторую базу и где можно про это почитать?

Можно

Строится так же как и первая

Так у вас уже на обоих островах базы есть.

Почитай в управление синдом, вкладка базы там все есть

https://www.gwars.io/syndicate.php?id=7515&page=bases
У вас есть 2 база и можете воевать сразу на 2-х островах