Взял с базы чинук, перелетел на S попробовал превратить орнитоптер, надпись появляется, нажимаю, но ничего не происходит и так не только в порту, но и на всем острове

Потому что предмет должен быть в твоей собственности. Орнитоптер не копирует, а заменяет его.

Транспорт должен быть собственным , а не арендован

Купи паром с прочкой 64/64, или сточи паром сам
https://www.gwars.io/market.php?buy=1&item_id=parom