Доброго времени суток! Подскажите, а когда нпц качается на ауте у него тоже есть лимит по покимонам?

Только финансовый лимит.

Иногда кажется, что он в том же обвесе проводит меньше успешных боёв, но это только кажется.

Нет, боев как таковых нету. Есть некий скрипт, который генерирует исход боя на основании атрибутов нпса (оружие по уровню, кол-во хп, маскировка, тепловизор и т.д.).