Написано, что временные бонусы работать не будут.
То, что бонусы, до истечения которых прямо отсчитывается время работать не будут - это понятно, но есть вопросы.

1. Бонусы от ежедневных квестов - не будут работать?
2. Бонусы от квестовых вещей - будут работать?

Просто "временные бонусы" - обширное понятие вроде как. Те же самые "временные бонусы" дают некоторые вещи, но просто время до истечения таких бонусов не отсчитывается.

Временный бонус - если он действует в течении какого-то времени. ;)
С получения уровня, например, или же случайный бонус длительностью 2 часа.
Дейлик и бонусы с кв. шмота не являются временными.

1 да
2 да

Бонусы от работы на недвижимости синдиката - работать не будут?

4
Не будут.

Всё, что прописывается во временных - не работает.

Посмотреть временные бонусы можно на основной странице персонажа, закладка "Бонусы [*] и ресурсы [*]"