Поставил навыки сохранил. Они перепрыгивают???

В настройках:

Не применять навыки из комплектов
Включите, если не хотите, чтобы игра восстанавливала набор навыков, установленный на персонаже в момент сохранения комплекта.

Каждый комплект нужно пересохранить с нужными навыками.
Навыки привязаны к комплектам