В описании данного бонуса не вижу ясности изложения (не догоняю, виноват). У меня вопрос, если у меня нет никаких вообще бонусов на персонаже, кроме 3 единиц бонуса урона, будет ли 100 HP чистого урона + бонус урона (+3%) = 103 НР?

Да.