На сегодня имею квест: Убить хотя бы одного врага в 3 синдикатных боях: 0 из 3
Кто-нить пробовал пройти его в боях за бункер? Засчитывается?

бункер не считается

Даже при указании своего синдиката?

Бои за бункер не учитываются
[GanjaWiki : ЕК]

Спасибо