Если я загрузил до отказа какой нить ресурс на заводе и поменял профиль на
продукт, в котором меньшие затраты ресурса, а соответственно и меньше места на
складе.

К примера 3000 урана закинул на завод и поменял на производство вещи, которая
требует 45 урана на единицу. А это значит что можно максимум засунуть в него 1к
урана.

не пропадет ли излишек урана?

Нет

Гром

ресурсы с недвиги сами не пропадают. ни при каких условиях

Не пропадут. Просто на новом профиле выработаешь излишек, а потом только сможешь
покупать их на завод до максимума.