Сбрасываются навыки персонажа.
Например для дробовиков: был выставлен "Выстрел из тени", ставлю "Длинные руки", сохраняю (!!) навыки, провожу бой, выхожу из игры, потом через какое-то время захожу, а навык снова сброшен на "Выстрел из тени". Тоже самое относится и ко всем другим пассивным/активным навыкам всех остальных видов оружия.
Играя в приложении для телефона - та же ситуация.
Короче, навыки не сохраняются - сбрасываются к предыдущим.

А! сбрасываются при смене амуниции

Убери галочку "Применять навыки из комплектов"

Ой) наоборот надо галку поставить Не применять навыки из комплектов)

Хм, спасибо, вроде сработало)