меняю и сохроняю навыки. Через пару минут меняю оружие и все возвращается на то
что было до изменений. Раньше такого не наблюдал

То же самое

в настройках убери галку привязки навыков к комплектам

3+ или после выставления навыков пересохрани комплект. Они теперь привязаны к
комплектам.

Спасибо